1986年，山东科技大学（原山东矿业学院）计算数学专业本科毕业。
1991年，获山东科技大学计算机软件与理论硕士。
1995年，于中国科学院自动化研究所获控制理论与工程博士。
1997年，于中国科学院计算技术研究所计算机科学与技术学科完成博士后工作。
1986年-1998年，于山东科技大学工作。
1992年、1995年，破格晋升副教授和教授。
1998年，任山东科技大学校长助理。
1997年，聘为中国科学院自动化研究所客座研究员、博士生导师。
1997年-1998年，在香港城市大学任客座研究员。
1999年，任同济大学计算机系教授、博士生导师。
2000年，同济大学计算机系系主任、电子与信息工程学院副院长、院长、同济大学校长助理。
2008年12月-2015年3月，任同济大学副校长。
2015年3月16日，教育部党组成员、副部长杜占元在东华大学宣布**教育部党组的任免决定，蒋昌俊担任东华大学校长。
学术职务主要学术职务有：国家自然科学基金委信息学部咨询委员会委员、中国云体系产业创新战略联盟副理事长、中国人工智能学会副理事长、中国计算机学会Petri网专委主任、上海市科协副**、美国电子电气工程师学会（IEEE）上海分会副**等。担任计算机学报、软件学报、电子学报、Computer & Communications等国内外期刊编委或客座编辑。
科研成就蒋昌俊长期从事并发理论、形式化方法与大规模信息服务的工程应用研究工作，作为项目负责人先后承担了国家自然科学基金（重大计划、重点、面上）、973计划、863计划和国际重点合作项目等50余项，申请发明专利20余项（已获授权2项），获软件著作权2项；在《中国科学》、《IEEE Transactions on Robotics & Automation》、《IEEE Transactions on Fuzzy Systems》、《IEEE Transactions on Systems, Man, and Cybernetics Part A》、《IEEE Transactions on Systems, Man, and Cybernetics Part B》和《IEEE Transactions on Systems, Man, and Cybernetics Part C》等国内外重要学术刊物上发表论文180篇，SCI和EI收录80余次，他人引用100余次，出版学术专著4部（中科院科学出版基金等支持）；先后获得全国首届百篇优秀博士论文（1999年）、高校青年教师奖（2001年），入选国家杰出青年科学基金（2001年）、教育部优秀创新团队负责人（2007年）、教育部优秀青年教师教学科研奖励计划（2001年）、上海市领**才计划（2009年）、上海市优秀学科带头人计划（2004年）、上海市曙光计划（2000年）及其跟踪计划（2008年）等。
荣誉记录1997年，蒋昌俊获得DEDS领域何潘清漪奖1项。
2008年，蒋昌俊获教育部科技进步一等奖（第1位）等其它省部级科技成果奖6项。
2009年，蒋昌俊获上海市教学成果一等奖（第1位）。
2010年，蒋昌俊以“基于虚拟超市技术的大规模网络资源管理及其应用”**完**，获得国家技术发明奖二等奖。
2010年起，担任国家重点基础研究发展计划（973计划）项目“信息服务的模型与机理研究”首席科学家，主持项目的研究进行。
2013年，以“城市交通智能路网的关键技术及应用”项目获得国家科技进步二等奖。
2017年4月21日，蒋昌俊入选中国工程院颁布的增选有效候选人提名名单。
2017年10月，蒋昌俊当选首批中国人工智能学会会士。