从2008年开始，李明洲便在导师 李学伟的指导下，联合深圳 华大基因及中国、美国、英国和加拿大等四国共12个科研单位的50多位科研人员一起研究猪的脂肪和 肌肉组织。当时，研究的目的仅仅是希望通过研究，能了解猪肉的机理，让肉质更为健康，更具营养。
研究成果通过3年的实验观测和对猪各部位脂肪的DNA数据的分析，加上1年的验证期，李明洲发现，不同部位的脂肪对猪身体的危害程度也是不同的。 比如脏器里的脂肪就危害极大，特别是胸腔内部的 内脏脂肪，其次是腹部脏器的脂肪。此外，他所参与的研究还首次从表观遗传学角度证明了肌间 脂肪组织也是导致肥胖风险的一个重要因素。“也就是说，肌肉之间的脂肪，是导致猪肥胖的一个重要因素，对其身体无益。”
5月22日，由李明洲作为**作者的《猪脂肪和肌肉组织的基因组甲基化图谱》论文发表 在了国际著名学术杂志Nature子刊Nature Communications上，让李明洲本人都感到意外的是，这篇论文仅仅一天时间就被付费**了2808次，而这本权威期刊每篇文章平均每年的**量也就1900~2800次。不少医学界的专家在看了文章后，认为这项研究对人类肥胖的研究有突出贡献。
该研究首次构建了猪不同部位脂肪和肌肉组织的 DNA甲基化图谱，为预防人类肥胖疾病的发生和促进猪肌肉生长及脂肪沉积这一重要经济性状的研究，奠定了重要的表观遗传学基础。
本研究为与肥胖相关的生物医学研究提供了宝贵的资源，同时也为挖掘猪重要经济性状的功能基因奠定了重要的分子基础，这对提高猪的分子育种效率，实现猪肉健康生产、保障食品安全具有十分重要的意义。
人物奖励2012年5月25日，学校在中心组学习会上举行教 授二级岗特聘及科研奖助金发放仪式，特聘李明洲副教授为教授二级岗，给予 李学伟教授课题组奖助金，其中：80万元作为课题组奖金，220万元作为课题组研究经费。学校党委书记 邓良基、校长 郑有良，校学术委员会主任 荣廷昭院士，党委副书记 秦自强、 庄天慧，副校长 张强、 杨文钰、 陈代文、 王曙光等出席会议。会议由庄天慧主持。郑有良宣读了《关于特聘李明洲为教授二级岗暨给予李学伟教授课题组奖助金的决定》。