司马干字子良，是晋宣帝 司马懿的儿子，母为宣穆皇后 张春华。 他少年在 曹魏时因为是名臣的儿子被封为安阳 亭侯，逐渐升任抚军 中郎将， 进封平阳 乡侯。
咸熙元年（ 264年）， 五等爵制建立，改封司马干为定陶伯。
泰始元年（ 265年）， 司马炎代魏建立 西晋，司马干受封为平原王，食邑一万一千三百户，特赐他 鼓吹、 副车之马二匹及 侍中的服饰。
性理不恒咸宁三年（277年），司马炎下诏命没有官职的诸侯王都回到自己的 封国。但司马干有无法治愈的间歇性精神病，而他也比较清高，对名利不大感兴趣，对情欲感觉比较淡泊，所以司马炎特别下诏把他留下来。 太康（ 280年―289年）末年，司马干被拜为 光禄大夫，加侍中，由特赐 金章紫绶，地位仅次于 三公。
永熙元年（290年），晋惠帝 司马衷即位， 进拜司马干为 左光禄大夫，侍中如旧，允许佩剑穿鞋上朝，入朝时不用一路小跑。
司马干虽然被封在大国，但从来不管理封国的事务，封国里有官职调动，一定以能力来变动。他的官俸和封国的租税，好像都不是自己的一样，他的俸禄和 布帛，都因露天堆积而腐烂。阴雨天时就把牛车放在外面而把 露车收回来，有人问他为什么这样做，司马干回答说：“露车应该在内。”朝臣拜访他时，就算已经通报姓名，司马干也一定让他在门外等半天，或者过了一整天都不见。当时能够得到他接见的贤士，司马干在与他们应酬接待时，也是恭敬谦逊很温顺的样子，没有不正常的地方。他前后的爱妾死去，等到下葬时，一般都把棺钉起来，总把棺椁放在空房子里，几天打开看一次，奸**体，等到*体腐坏后才盖棺下葬。
百钱贺王元康十年（ 300年），赵王 司马伦辅政，任命司马干为 卫将军。
永宁元年（ 301年），司马衷复位，再次任命司马干为侍中，加职 太保。齐王 司马�谆靼艽畚坏乃韭砺祝�迎接司马衷复位时，宗室和朝臣都用牛酒来犒劳他，只有司马干拿着一百钱，告诫司马�姿�说：“赵王谋逆作*，你能做出正义的举动，这是你的功劳，现在我拿一百钱来祝贺你。尽管这样，但在高位上很难坐稳，你不可以不谨慎。”司马�赘ㄕ�后，司马干去拜见他，司马�浊淄� 迎拜。司马干入府后，坐在司马�椎拇采希�也不叫他坐，只是对他说：“你不要效仿白女儿（指司马伦）。”
永宁二年（ 302年）十二月，司马�妆簧保�司马干知道后非常悲伤的哭泣，对左右的侍从说：“宗室日渐衰微，只有这孩子最优秀，又把他*了，宗室从今以后完了！”
高龄而终光熙元年（ 306年），东海王司马越挟持司马衷，司马越到洛阳后，前往看望司马干，司马干闭门不让他通报。司马越在他家门前停车等了很久，司马干才让人致歉让他回去，而自己门缝中偷看司马越。当时的人都不知道他的想法，有人说因为他有疾病，有人认为他是隐居匿迹。
永嘉五年（ 311年）正月二十二日（2月26日），司马干去世，享年八十岁。不久后，正逢 刘聪包围洛阳，所以来不及赠予司马干 谥号。
历史评价房玄龄等《 晋书》：①平原性理不恒，世莫之测。及其处*离之际，属交争之秋，而能远害全身，享兹介福，其愚不可及已！②文宣孙子，或贤或鄙。...干虽静退，性乖恒理。
家庭成员 父母晋宣帝 司马懿
宣穆皇后 张春华
同母兄晋景帝 司马师
晋文帝 司马昭
儿子司马干有二子：
史书记载《 晋书・卷三十八・列传第八》