基因组必须指出仅有一个基因组并不能获得物种的遗传差异或遗传多态性。例如，原则上讲，人类基因组序列可以仅仅从某个个体的一个细胞的一半DNA中测定。要知道是哪些DNA变异导致特定性状或疾病则需要进行个体间比较。这一点也解释了通常使用“基因组”（与通常使用“基因”相提并论）不仅仅指某特定DNA序列，也指某物种整个家族的序列。
微生物遗传变异的特点有哪些？例如：大多数的病*菌体仅由蛋白质和DNA(或RNA)组成， 一旦菌体的DNA发生变异，菌体的性状一般都立即反映出相对 应的变异来。这就是为什么确定DNA是遗传物质的巨大科研成 果，首先是在对微生物的研究中获得的原因。(2)微生物的新陈代谢活动是由菌体直接与周围环境进行 的。